Studiare

In questa sezione è possibile reperire le informazioni riguardanti l'organizzazione pratica del corso, lo svolgimento delle attività didattiche, le opportunità formative e i contatti utili durante tutto il percorso di studi, fino al conseguimento del titolo finale.

A.A. 2008/2009

Calendario accademico

Il calendario accademico riporta le scadenze, gli adempimenti e i periodi rilevanti per la componente studentesca, personale docente e personale dell'Università. Sono inoltre indicate le festività e le chiusure ufficiali dell'Ateneo.
L’anno accademico inizia il 1° ottobre e termina il 30 settembre dell'anno successivo.

Calendario accademico

Calendario didattico

Il calendario didattico indica i periodi di svolgimento delle attività formative, di sessioni d'esami, di laurea e di chiusura per le festività.

Anno accademico:
Definizione dei periodi di lezione
Periodo Dal Al
1° Sem 1-ott-2008 6-feb-2009
2° Sem 9-mar-2009 12-giu-2009
Sessioni degli esami
Sessione Dal Al
Sessione straordinaria 9-feb-2009 6-mar-2009
Sessione estiva 22-giu-2009 31-lug-2009
Sessione autunnale 1-set-2009 30-set-2009
Sessione Straord. solo 1° anno 1-feb-2010 28-feb-2010
Sessioni di lauree
Sessione Dal Al
Sessione straordinaria 1-dic-2008 2-dic-2008
Sessione invernale 18-mar-2009 19-mar-2009
Sessione estiva 22-lug-2009 23-lug-2009
Sessione autunnale 14-ott-2009 15-ott-2009
Vacanze
Periodo Dal Al
Festa di Ognissanti 1-nov-2008 1-nov-2008
Festa dell'Immacolata Concezione 8-dic-2008 8-dic-2008
Vacanze di Natale 22-dic-2008 6-gen-2009
Vacanze di Pasqua 10-apr-2009 14-apr-2009
Festa della Liberazione 25-apr-2009 25-apr-2009
Festa del Lavoro 1-mag-2009 1-mag-2009
Festa del Santo Patrono 21-mag-2009 21-mag-2009
Festa della Repubblica 2-giu-2009 2-giu-2009
Vacanze estive 8-ago-2009 16-ago-2009

Calendario esami

Gli appelli d'esame sono gestiti dalla Unità Operativa Didattica e Studenti Scienze e Ingegneria.
Per consultazione e iscrizione agli appelli d'esame visita il sistema ESSE3.
Per problemi inerenti allo smarrimento della password di accesso ai servizi on-line si prega di rivolgersi al supporto informatico della Scuola o al servizio recupero credenziali

Calendario esami

Per dubbi o domande leggi le risposte alle domande più frequenti F.A.Q. Iscrizione Esami

Docenti

B C D F G L P T Z

Bassi Roberto

roberto.bassi@univr.it 045 802 7916; Lab: 045 802 7915

Cecconi Daniela

daniela.cecconi@univr.it +39 045 802 7056; Lab: +39 045 802 7087

Dal Belin Peruffo Angelo

angelo.peruffo@univr.it

Delledonne Massimo

massimo.delledonne@univr.it 045 802 7962; Lab: 045 802 7058

Dominici Paola

paola.dominici@univr.it 045 802 7966; Lab: 045 802 7956-7086
FF DBT_UNIVR_WEBSITE,  12 giugno 2015

Fatone Francesco

francesco.fatone@univr.it 045 802 7965

Felis Giovanna

giovanna.felis@univr.it +390456835627

Furini Antonella

antonella.furini@univr.it 045 802 7950; Lab: 045 802 7043

Giorgetti Alejandro

alejandro.giorgetti@univr.it 045 802 7982

Guzzo Flavia

flavia.guzzo@univr.it 045 802 7923

Luciani Fabio

Pezzotti Mario

mario.pezzotti@univr.it +39045 802 7951

Polverari Annalisa

annalisa.polverari@univr.it 045 8027064

Torriani Sandra

sandra.torriani@univr.it 045 802 7921

Zapparoli Giacomo

giacomo.zapparoli@univr.it +390458027047

Zoccatelli Gianni

gianni.zoccatelli@univr.it +39 045 802 7952

Piano Didattico

Il piano didattico è l'elenco degli insegnamenti e delle altre attività formative che devono essere sostenute nel corso della propria carriera universitaria.
Selezionare il piano didattico in base all'anno accademico di iscrizione.

InsegnamentiCreditiTAFSSD
3
F
(BIO/10)
InsegnamentiCreditiTAFSSD
InsegnamentiCreditiTAFSSD
InsegnamentiCreditiTAFSSD
5
S
(BIO/10)

1° Anno

InsegnamentiCreditiTAFSSD
3
F
(BIO/10)

2° Anno

InsegnamentiCreditiTAFSSD

3° Anno

InsegnamentiCreditiTAFSSD

4° Anno

InsegnamentiCreditiTAFSSD
5
S
(BIO/10)
Insegnamenti Crediti TAF SSD
Tra gli anni: 4°- 5°Esami a scelta dello studente tra quelli disponibili nell'ambito di sede per complessivi 18 crediti (IV e V anno)
4
S
(ING-IND/25)
4
S
(AGR/07 ,AGR/16)

Legenda | Tipo Attività Formativa (TAF)

TAF (Tipologia Attività Formativa) Tutti gli insegnamenti e le attività sono classificate in diversi tipi di attività formativa, indicati da una lettera.




SStage e tirocini presso imprese, enti pubblici o privati, ordini professionali

Codice insegnamento

4S00183

Crediti

3

Coordinatore

Alejandro Giorgetti

L'insegnamento è organizzato come segue:

Laboratorio

Crediti

1

Periodo

1° Sem

Teoria

Crediti

2

Periodo

1° Sem

Obiettivi formativi

Modulo: Teoria
-------
Il corso si pone l'obiettivo di fornire gli strumenti informatici per l'analisi e l'interpretazione dei dati biologici. Si propone inoltre di stabilire le basi teoriche delle possibili applicazioni dei principali strumenti bioinformatici di uso corrente in proteomica, genomica, biochimica, biologia molecolare e strutturale, mettendo lo studente in grado di utilizzare programmi di genomica funzionale, proteomica e genomica strutturale.


Modulo: Laboratorio
-------
Il laboratorio mira a fornire agli studenti gli strumenti e i metodi necessari per accedere all'informazione biologica in modo razionale ed efficiente, utilizzando le risorse disponibili in rete e programmi d'ultima generazione.

Programma

Modulo: Teoria
-------
Banche dati in ambito biologico. Le banche dati biologiche primarie, derivate e integrate. Il formato FASTA. In particolare analizzeremo come queste banche dati sono utilizzate per l'annotazione di genomi procariotici ed eucariotici. Metodi statistici per la ricerca/annotazione di geni: matrici di punteggio sito-specifiche, Markov Models (MM). Sensibilità e specificità dei metodi. La banca dati ENSEMBL.

Metodi per la predizione e annotazione degli elementi funzionali del genoma. Metodi e programmi per la predizione di geni (ab initio, comparative), analisi dei promotori.

Annotazione funzionale dei geni. Mediante l'utilizzo della struttura dei prodotti genici, utilizzo della filogenesi Concetti di paralogia e ortologia. Database di famiglie e banche dati derivate. Classificazione di domini. Predizione di interazioni proteiche e geniche. Metodi knowledge-based per la predizione della funzione.

Analisi dell’espressione genica: Data mining di dati di espressione:
estrazione ed analisi di dati da database biologici.
Data mining di letteratura scientifica.
Progetto di sequenziamento del genoma umano e progetto ENCODE

Annotazione funzionale:
Gene Ontology (GO).
ENSEMBL

Utilizzo dei Microarray per l'analisi della espressione genica: Introduzione alle metodologie e studio delle tecniche per l’analisi dei dati: normalizzazione e filtering dei dati, banche dati, metodi di clustering.
Allineamento di sequenze. Matrici di punteggio PAM e BLOSUM, penalizzazione di inserzioni e delezioni. Algoritmi di allineamento esatti ed euristici. Esempio di algoritmi di allineamento esatti: le matrici cumulative.

Allineamenti multipli. Il programma Clustal W. L’informazione strutturale contenuta negli allineamenti multipli. Profili di sequenza.

L’evoluzione delle proteine. Famiglie e superfamiglie proteiche. Ricerca in banche dati per similarità. Significatività dell’allineamento. I programmi FASTA, BLAST e PSI-BLAST.

Predizione della struttura tridimensionale di una proteina:
Modelling comparativo, Fold Recognition e metodi Ab initio. Relazione quantitativa per la conservazione della struttura primaria e terziaria in proteine omologhe. Il core proteico e le regioni strutturalmente divergenti (SDR). Passaggi per la costruzione di un modello comparativo. Librerie di rotameri. Modelling dei loop. Metodi statistici basati su parametri geometrici e di impacchettamento proteico. Applicazione al controllo di un modello proteico.


Modulo: Laboratorio
-------
Utilizzo dei database in ambito biologico, loro struttura e metodologie di interrogazione.

Metodiche di allineamento di sequenze.
L’evoluzione e la filogenesi. Ricerca in banche dati per similarità. Significatività dell’allineamento. Riconoscimento di omologia. I programmi FASTA, BLAST e PSI-BLAST.

Predizione della struttura tridimensionale di una proteina: Modelling comparativo. Fold recognition e Ab initio. Utilizzo dei principali programmi.

Laboratorio di Genomica:

Predizione automatica di geni utilizzando i programmi di utlima generazione.
Utilizzo della banca dati ENSEMBL.
Analisi dell’espressione genica: Data mining di dati di espressione:
. estrazione ed analisi di dati da database biologici.
. Data mining di letteratura scientifica.

Annotazione funzionale:
. Gene Ontology (GO).
. geni ortologhi: loro funzione nell’annotazione funzionale.

Microarray: Utilizzo dei principali programmi e banche dati .

Modalità d'esame

Modulo: Teoria
-------
Scritto


Modulo: Laboratorio
-------
scritto

Tipologia di Attività formativa D e F

Anno accademico:

Insegnamenti non ancora inseriti

Prospettive


Avvisi degli insegnamenti e del corso di studio

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