Studiare
In questa sezione è possibile reperire le informazioni riguardanti l'organizzazione pratica del corso, lo svolgimento delle attività didattiche, le opportunità formative e i contatti utili durante tutto il percorso di studi, fino al conseguimento del titolo finale.
Calendario accademico
Il calendario accademico riporta le scadenze, gli adempimenti e i periodi rilevanti per la componente studentesca, personale docente e personale dell'Università. Sono inoltre indicate le festività e le chiusure ufficiali dell'Ateneo.
L’anno accademico inizia il 1° ottobre e termina il 30 settembre dell'anno successivo.
Calendario didattico
Il calendario didattico indica i periodi di svolgimento delle attività formative, di sessioni d'esami, di laurea e di chiusura per le festività.
| Periodo | Dal | Al |
|---|---|---|
| I sem. | 2-ott-2017 | 31-gen-2018 |
| II sem. | 1-mar-2018 | 15-giu-2018 |
| Sessione | Dal | Al |
|---|---|---|
| Sessione invernale d'esami | 1-feb-2018 | 28-feb-2018 |
| Sessione estiva d'esame | 18-giu-2018 | 31-lug-2018 |
| Sessione autunnale d'esame | 3-set-2018 | 28-set-2018 |
| Sessione | Dal | Al |
|---|---|---|
| Sessione Estiva Lauree Magistrali | 19-lug-2018 | 19-lug-2018 |
| Sessione Autunnale Lauree Magistrali | 18-ott-2018 | 18-ott-2018 |
| Sessione Invernale Lauree Magistrali | 21-mar-2019 | 21-mar-2019 |
| Periodo | Dal | Al |
|---|---|---|
| Vacanze di Natale | 22-dic-2017 | 7-gen-2018 |
| Vacanze di Pasqua | 30-mar-2018 | 3-apr-2018 |
| Festa del Santo Patrono - S. Zeno | 21-mag-2018 | 21-mag-2018 |
| Vacanze estive | 6-ago-2018 | 19-ago-2018 |
Calendario esami
Gli appelli d'esame sono gestiti dalla Unità Operativa Didattica e Studenti Scienze e Ingegneria.
Per consultazione e iscrizione agli appelli d'esame visita il sistema ESSE3.
Per problemi inerenti allo smarrimento della password di accesso ai servizi on-line si prega di rivolgersi al supporto informatico della Scuola o al servizio recupero credenziali
Per dubbi o domande leggi le risposte alle domande più frequenti F.A.Q. Iscrizione Esami
Docenti
Bloisi Domenico Daniele
domenico.bloisi@univr.it
Piano Didattico
Il piano didattico è l'elenco degli insegnamenti e delle altre attività formative che devono essere sostenute nel corso della propria carriera universitaria.
Selezionare il piano didattico in base all'anno accademico di iscrizione.
| Insegnamenti | Crediti | TAF | SSD |
|---|
| Insegnamenti | Crediti | TAF | SSD |
|---|
1° Anno
| Insegnamenti | Crediti | TAF | SSD |
|---|
2° Anno
| Insegnamenti | Crediti | TAF | SSD |
|---|
| Insegnamenti | Crediti | TAF | SSD |
|---|
Legenda | Tipo Attività Formativa (TAF)
TAF (Tipologia Attività Formativa) Tutti gli insegnamenti e le attività sono classificate in diversi tipi di attività formativa, indicati da una lettera.
Natural computing (2017/2018)
Codice insegnamento
4S004557
Docenti
Coordinatore
Crediti
6
Offerto anche nei corsi
Settore Scientifico Disciplinare (SSD)
INF/01 - INFORMATICA
Lingua di erogazione
Inglese
Periodo
I sem. dal 2-ott-2017 al 31-gen-2018.
Obiettivi formativi
Nel corso vengono presentati dei modelli di calcolo naturale, intesi come processi computazionali (osservati in e) ispirati dalla natura. Verranno prima richiamati alcuni modelli di calcolo classici, quali linguaggi formali e automi, e poi illustrati diversi modelli di calcolo ispirati dalla biologia, compresi gli algoritmi biomolecolari.
Vengono assunte alcune nozioni fondamentali di matematica discreta (insiemi, multinsiemi, sequenze, alberi, grafi, induzione, grammatiche e automi di calcolo), di analisi, algebra lineare e probabiluta', per spiegare alcuni metodi di analisi dell'informazione genomica e di reti metaboliche.
Sono obiettivi formativi del corso: i) approfondire la padronanza dello studente sulle principali strutture e dinamiche discrete e sulla nozione di calcolo, ii) sviluppare la sua capacita' di riconoscerle anche in sistemi di calcolo non convenzionali, come possono essere quelli biologici, e iii) sviluppare una competenza algoritmica che si estenda al mondo naturale, e in particolare molecolare. In sede di esame verra' testata la conoscenza dello studente di tutto quanto trattato in classe, contestualmente alla sua capacita' di apprendimento e comprensione.
Programma
Introduzione al calcolo naturale, agli algoritmi biologici, alle strategie algoritmiche della vita.
Richiami di matematica discreta e di teoria dei linguaggi formali (gerarchia di Chomsky, automi, e calcolabilita').
Elementi di teoria dell'informazione (sorgenti informative, codici, entropia e divergenze entropiche, sequenze tipiche, primo e secondo teorema di Shannon).
Metodi di estrazione e di analisi di dizionari genomici.
Profili genomici e distribuzioni di motivi ricorrenti.
Utilizzo software IGtools di analisi e visualizzazione di dati genomici.
Modelli computazionali di processi biomolecolari, calcoli a membrane.
Cenni di calcolo DNA, e di bio-complessita'.
Algoritmi DNA per risolvere problemi NP-completi.
Grammatiche MP, reti, e dinamiche metaboliche.
Bibliografia
| Autore | Titolo | Casa editrice | Anno | ISBN | Note |
|---|---|---|---|---|---|
| Gheorghe Paun, Grzegorz Rozenberg, Arto Salomaa | DNA computing: new computing paradigms (Edizione 3) | Springer | 2013 | Previous editions: 1998, 2006. | |
| Martin A. Nowak | Evolutionary Dynamics (Edizione 1) | Harvard University Press | 2006 | 0-674-02338-3 | |
| Vincenzo Manca | Infobiotics | Springer | 2013 |
Modalità d'esame
-- Unico esame scritto, come ultima prova nel corso, che propone una lista di circa dieci domande su tutto il programma svolto. Lo studente supera l'esame se risponde correttamente alla maggioranza delle domande, raggiungendo una valutazione di almeno 18 trentesimi.
-- Esame orale, su tutto il programma, ad ogni appello. Lo studente supera l'esame se raggiunge o supera una valutazione di almeno 18 trentesimi.
Le domande dello scritto e dell'orale vertono sia su teoremi e dimostrazioni, che su conoscenza di algoritmi e metodi di analisi di dati, che sulla verifica della capacita' di risolvere nuovi esercizi e di applicare le conoscenze acquisite a nuovi contesti. In questa sede, lo studente dimostra di aver raggiunto un livello almeno sufficiente di conoscenza dei concetti del corso, esprimendo la propria capacita' di apprendimento, comprensione, e di comunicazione.
Progetto facoltativo, che consiste nell'approfondimento di un argomento o nello sviluppo di software per applicare a sistemi biologici specifici i metodi appresi nel corso. La valutazione del progetto e' indipendente, concordata con lo studente, intesa come aggiunta di punteggio al voto di esame, gia' superato con lo scritto o con l'orale. In questa sede, facoltativa, lo studente ha occasione di applicare quanto ha imparato, eventualmente esprimendo autonomia e intraprendenza.
Materiale Didattico
-
AlgoritmiBiotecnologici
(pdf, en, 1504 KB, 26/10/17)
-
AlgoritmiDNA
(pdf, en, 9630 KB, 24/10/17)
-
CalcoliMembrana
(pdf, en, 4580 KB, 15/11/17)
-
CalcoliMetabolici
(pdf, en, 6521 KB, 22/11/17)
-
ChomskyGrammars
(pdf, en, 7912 KB, 14/12/17)
-
Follow-up
(pdf, en, 15635 KB, 08/11/17)
-
GenomicaInformazionale
(pdf, en, 13545 KB, 04/11/17)
-
IGtools
(zip, en, 6431 KB, 08/11/17)
-
Informazione-Vita
(pdf, en, 1974 KB, 18/10/17)
-
LezioniIntroduttive
(pdf, en, 10895 KB, 10/10/17)
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LezioniProfManca
(pdf, en, 9932 KB, 14/12/17)
-
SolutionTest19Dec
(pdf, en, 237 KB, 19/12/17)
-
Test Grades
(pdf, en, 53 KB, 08/01/18)
-
TuringMachines
(pdf, en, 807 KB, 14/12/17)
Tipologia di Attività formativa D e F
Insegnamenti non ancora inseriti
Prospettive
Avvisi degli insegnamenti e del corso di studio
Per la comunità studentesca
Se sei già iscritta/o a un corso di studio, puoi consultare tutti gli avvisi relativi al tuo corso di studi nella tua area riservata MyUnivr.
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Prova Finale
Per gli avvisi sulle sessioni di laurea, si rimanda al relativo servizio.
Alla tesi di laurea sono dedicati 24 CFU, per un lavoro che non deve superare i 4-5 mesi a tempo pieno per la/o studentessa/studente.
La tesi di laurea sarà compilata e discussa in lingua inglese, anche mediante l'ausilio di supporti multimediali quali slide, filmati, immagini e suoni.
Scopo della Tesi di Laurea
Scopo della tesi è quello di sviluppare uno studio originale che può culminare con un progetto applicativo o un risultato teorico connesso a specifici problemi di natura progettuale o una rassegna critica sullo stato dell'arte in un determinato ambito di studio. Nel corso dello svolgimento della Tesi il laureando dovrà, sotto la guida del relatore ed eventuali correlatori, affrontare lo studio e l'approfondimento degli argomenti scelti, ma anche acquisire capacità di sintesi e applicazione creativa delle conoscenze acquisite. Il contenuto della Tesi deve essere inerente a tematiche della bioinformatica e della informatica medica o discipline strettamente correlate. La Tesi consiste nella presentazione in forma scritta di attività che possono essere articolate come: -progettazione e sviluppo di applicazioni o sistemi; -analisi critica di contributi tratti dalla letteratura scientifica; -contributi originali di ricerca.
La Tesi può essere redatta sia in lingua inglese che in lingua italiana, e può essere discussa sia in inglese che in italiano, anche mediante l'ausilio di supporti multimediali quali slide, filmati, immagini e suoni. Nel caso di tesi redatta in lingua italiana alla medesima dovrà essere aggiunto un breve riassunto in lingua inglese.
Modalità di svolgimento e valutazione.
La prova finale consiste nello sviluppo di una tesi di laurea, che impegni lo studente in un lavoro di ricerca, formalizzazione, progettazione o sviluppo: tale lavoro contribuirà sostanzialmente al completamento della sua formazione tecnico-scientifica. Ogni tesi di Laurea può essere interna o esterna, a seconda che sia svolta presso l'Università di Verona o in collaborazione con un altro Ente. Ogni tesi prevede un relatore, eventualmente affiancato da uno o più correlatori, e un controrelatore. Il controrelatore è nominato dal Collegio Didattico almeno 20 gg prima della discussione della Tesi, verificata l'ammissibilità dello studente a sostenere l'esame di Laurea Magistrale. Per quanto riguarda gli aspetti giuridici (ad esempio, proprietà intellettuale dei risultati) legati alla Tesi e ai risultati ivi contenuti, si rimanda alla legislazione vigente in materia ed ai Regolamenti di Ateneo.
Valutazione delle Tesi
I criteri su cui sono chiamati ad esprimersi relatore ed eventuali correlatori e controrelatore sono i seguenti:
1. livello di approfondimento del lavoro svolto, in relazione allo stato dell'arte dei settori disciplinari di pertinenza informatica, con enfasi sulle applicazioni agli ambiti medici e biologici;
2. avanzamento conoscitivo o tecnologico apportato dalla Tesi;
3. impegno critico espresso dalla/dal laureanda/o;
4. impegno sperimentale e/o di sviluppo formale espresso dal laureando;
5. autonomia di lavoro espressa dalla/dal laureanda/o;
6. significatività delle metodologie impiegate;
7. accuratezza dello svolgimento e della scrittura;
La/il controrelatrice/controrelatore non è chiamata/o ad esprimersi sul punto 5.
Voto di Laurea.
Il voto di Laurea (espresso in 110mi) è un valore intero compreso tra 66/110 e 110/110 e viene formato dalla somma, arrotondata al numero intero più vicino (e.g., 93.50 diventa 94, 86.49 diventa 86), dei seguenti addendi:
1) media pesata sui crediti e rapportata a 110 dei voti conseguiti negli esami di profitto;
2) valutazione del colloquio di Laurea e della Tesi secondo le seguenti modalità:
a) attribuzione di un coefficiente compreso tra 0 e 1 (frazionario con una cifra decimale) per ciascuno dei punti 1-7 elencati sopra;
b) attribuzione di un coefficiente compreso tra 0 e 1 (frazionario con una cifra decimale) per la qualità della presentazione;
c) somma dei coefficienti attribuiti ai punti a e b.
La presenza di eventuali lodi ottenute negli esami sostenuti, la partecipazione a stage ufficialmente riconosciuti dal Collegio Didattico di Informatica, il superamento di esami in soprannumero ed il raggiungimento della Laurea in tempi contenuti rispetto alla durata legale del corso degli studi possono essere utilizzati dalla Commissione di Laurea per attribuire un ulteriore incremento di un punto. Qualora la somma ottenuta raggiunga 110/110, la Commissione può decidere l'attribuzione della lode. La lode viene
proposta e discussa dalla Commissioni, senza l'adozione di particolari meccanismi di calcolo automatico. In base alle norme vigenti, la lode viene attribuita solo se il parere è unanime
Tesi esterne
Una Tesi esterna viene svolta in collaborazione con un ente diverso dall'Università di Verona. In tal caso, il laureando dovrà preventivamente concordare il tema della Tesi con un relatore dell'Ateneo. Inoltre, è previsto almeno un correlatore appartenente all'ente esterno, quale riferimento immediato per lo studente nel corso dello svolgimento dell’attività di Tesi. Relatore e correlatori devono essere indicati nella domanda di assegnazione Tesi. Le modalità assicurative della permanenza dello studente presso l'Ente esterno sono regolate dalle norme vigenti presso l'Università di Verona. Se la Tesi si configura come un periodo di formazione presso tale ente, allora è necessario stipulare una convenzione tra l'Università e detto ente. I risultati contenuti nella Tesi sono patrimonio in comunione di tutte le persone ed enti coinvolti. In particolare, i contenuti ed i risultati della Tesi sono da considerarsi pubblici. Per tutto quanto riguarda aspetti non strettamente scientifici (e.g. convenzioni, assicurazioni) ci si rifà alla delibera del Senato Accademico del 12 gennaio 1999.
Relatore, correlatori, controrelatori. La Tesi di Laurea viene presentata da un relatore. Relatore può essere un docente di ruolo del corso di Laurea Magistrale in Medical Bioinformatics o del Dipartimento di Informatica o inquadrato nei SSD ING/INF/05 e INF/01 dell’Ateneo. Oltre a coloro che hanno i requisiti indicati rispetto al ruolo di relatore (come indicato sopra), possono svolgere il ruolo di correlatori anche ricercatori operanti in istituti di ricerca extra-universitari assegnisti di ricerca, titolari di borsa di studio post-dottorato, dottorandi di ricerca, personale tecnico del Dipartimento, cultori della materia nominati da un Ateneo italiano ed ancora in vigore, referenti aziendali esperti nel settore considerato nella Tesi. Controrelatore può essere nominato qualunque docente dei settori scientifico-disciplinari presenti nell’offerta didattica della laurea magistrale in Medical Bioinformatics e in servizio presso l'Università degli Studi di Verona, che risulti particolarmente competente nell'ambito specifico di studio della Tesi.
Gestione carriere
Modalità di frequenza
Come riportato al punto 25 del Regolamento Didattico per l'A.A. 2021/2022, la frequenza al corso di studio non è obbligatoria.Per le modalità di erogazione della didattica, si rimanda alle informazioni in costante aggiornamento dell'Unità di Crisi.
Ulteriori servizi
I servizi e le attività di orientamento sono pensati per fornire alle future matricole gli strumenti e le informazioni che consentano loro di compiere una scelta consapevole del corso di studi universitario.