Formazione e ricerca
Attività Formative del Corso di Dottorato
In questa pagina sono riportate le attività formative del corso di dottorato per l'anno accademico 2024/2025. Ulteriori attività verranno aggiunte durante l'anno. Ti invitiamo a verificare regolarmente la presenza di aggiornamenti!
Metabolic engineering to increase biomass/biomolecules productivity: from fundamental science to industrial applications
Crediti: 3
Lingua di erogazione: inglese
Docente: Federico Perozeni, Matteo Ballottari
Mid-Infrared spectroscopy and micro-spectroscopy: physical principles and applications in biotechnological research
Crediti: 2
Lingua di erogazione: English/Italian
Docente: Francesca Monti
Signaling peptides and their application in agriculture and pharmacology
Crediti: 3
Lingua di erogazione: Inglese
Docente: Tiziana Pandolfini
Sustainability in Ecosystems and Agroecosystems
Crediti: 2
Lingua di erogazione: English
Docente: Matteo Dainese, Annalisa Polverari
In vitro cell cultivation: from health to food. Part 1: Introduction to the Advanced Aspects of the Proposed Topic
Crediti: 1
Lingua di erogazione: INGLESE
Docente: Flavia Guzzo, Daniele Guardavaccaro
In vitro cell cultivation: from health to food. Part 2: advanced research and application of in vitro cell cultures (stem cell culture, organoids, cultivated meats)
Crediti: 2
Lingua di erogazione: english
Docente: Flavia Guzzo
Citizen science: from bioprospection to beyond
Crediti: 2
Lingua di erogazione: English
Docente: Matteo Dainese, Linda Avesani
New genetics’ toolbox for sustainable agriculture and human health-part 1: Introduction to the Advanced Aspects of the Proposed Topic
Crediti: 1
Lingua di erogazione: Inglese
Docente: Sara Zenoni
New genetics’ toolbox for sustainable agriculture and human health-part 2: examples of applications
Crediti: 2.5
Lingua di erogazione: Inglese
Docente: Sara Zenoni, Andrea Vettori
New genetics’ toolbox for sustainable agriculture and human health-part 3: proteomic phenotyping
Crediti: 2
Lingua di erogazione: inglese
Docente: Daniela Cecconi
New genetics’ toolbox for sustainable agriculture and human health-part 3: proteomic phenotyping (2024/2025)
Docente
Crediti
2
Lingua di erogazione
inglese
Frequenza alle lezioni
Scelta Libera
Sede
VERONA
Obiettivi di apprendimento
Il corso si prefigge di condurre gli/le studenti/studentesse all'essere in grado di comprendere sia le diverse applicazioni della tecnologia CRISPR-Cas alla proteomica, che i diversi utilizzi della proteomica per confermare la mutazione genica e monitorare l’impatto dell’editing genomico sul proteoma totale. Inoltre la parte pratica “hands-on” del corso si prefigge di condurre gli/le studenti/studentesse all'essere in grado di utilizzare i principali strumenti bioinformatici che consentono l’interpretazione di dataset proteomici per individuare gli effetti sul fenotipo dell’editing con CRISPR-Cas9.
Prerequisiti e nozioni di base
Nozioni di base riguardanti l’analisi proteomica.
Programma
Parte di apprendimento teorico:
• Applicazioni di CRISPR-Cas alla proteomica per: lo studio delle interazioni proteina-proteina, l’analisi delle interazioni proteina-cromatina e la generazione di modelli cellulari
• Applicazione della proteomica per confermare la mutazione genica tramite CRISPR-Cas9 a livello proteico e per la quantificazione del prodotto bersaglio
• Applicazione della proteomica per monitorare i cambiamenti nel proteoma totale esplorando così l'impatto complessivo dell'editing genomico sull'espressione proteica
• Analisi bioinformatica per consentire l'interpretazione di dati proteomici e fornire risultati biologicamente rilevanti circa gli effetti sul fenotipo dell’editing con CRISPR-Cas9.
Parte pratica di apprendimento:
• Lezione pratica di bioinformatica con utilizzo dei principali strumenti disponibili online (ad es. Cytoscape, WebGestalt, PANTHER, DAVID, STRING) per analizzare l’effetto sul fenotipo proteomico dell’editing con CRISPR-Cas9. In particolare verranno effettuate analisi di arricchimento funzionale delle proteine differenzialmente espresse rispetto ai termini della Gene Ontology e rispetto a pathway attivati, e analisi delle reti di interazione proteina-proteina.
Modalità didattiche
Lezioni frontali
Modalità di verifica dell'apprendimento
/
Valutazione
/
Lezioni Programmate
| Quando | Aula | Docente | Argomenti |
|---|---|---|---|
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venerdì 26 settembre 2025 10:30 - 12:30 Durata: 02:00 |
Ca' Vignal - Piramide - Verde [2 - 0] | Daniela Cecconi | CRISPR-Cas & Proteomics (Theoretical part) |
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venerdì 26 settembre 2025 14:30 - 16:30 Durata: 02:00 |
Ca' Vignal 3 - T.02 [02 - T] | Daniela Cecconi | CRISPR-Cas & Proteomics (Practical "Hands-on" part) |
