Studiare

In questa sezione è possibile reperire le informazioni riguardanti l'organizzazione pratica del corso, lo svolgimento delle attività didattiche, le opportunità formative e i contatti utili durante tutto il percorso di studi, fino al conseguimento del titolo finale.

Calendario accademico

Il calendario accademico riporta le scadenze, gli adempimenti e i periodi rilevanti per la componente studentesca, personale docente e personale dell'Università. Sono inoltre indicate le festività e le chiusure ufficiali dell'Ateneo.
L’anno accademico inizia il 1° ottobre e termina il 30 settembre dell'anno successivo.

Calendario accademico

Calendario didattico

Il calendario didattico indica i periodi di svolgimento delle attività formative, di sessioni d'esami, di laurea e di chiusura per le festività.

Anno accademico:

Per l'anno 2003/2004 Nessun calendario ancora disponibile

Calendario esami

Gli appelli d'esame sono gestiti dalla Unità Operativa Segreteria Corsi di Studio Scienze e Ingegneria.
Per consultazione e iscrizione agli appelli d'esame visita il sistema ESSE3.
Per problemi inerenti allo smarrimento della password di accesso ai servizi on-line si prega di rivolgersi al supporto informatico della Scuola o al servizio recupero credenziali

Calendario esami

Per dubbi o domande leggi le risposte alle domande più frequenti F.A.Q. Iscrizione Esami

Docenti

B C D F G L P T Z

Bassi Roberto

symbol email roberto.bassi@univr.it symbol phone-number 045 8027916

Cecconi Daniela

symbol email daniela.cecconi@univr.it symbol phone-number +39 045 802 7056; Lab: +39 045 802 7087
Dal Belin PeruffoAngelo

Dal Belin Peruffo Angelo

symbol email angelo.peruffo@univr.it

Delledonne Massimo

symbol email massimo.delledonne@univr.it symbol phone-number 045 802 7962; Lab: 045 802 7058

Dominici Paola

symbol email paola.dominici@univr.it symbol phone-number 045 802 7966; Lab: 045 802 7956-7086
FF DBT_UNIVR_WEBSITE,  12 giugno 2015

Fatone Francesco

symbol email francesco.fatone@univr.it symbol phone-number 045 802 7965

Felis Giovanna

symbol email giovanna.felis@univr.it symbol phone-number +390458425627

Furini Antonella

symbol email antonella.furini@univr.it symbol phone-number 045 802 7950; Lab: 045 802 7043

Giorgetti Alejandro

symbol email alejandro.giorgetti@univr.it symbol phone-number 045 802 7982

Guzzo Flavia

symbol email flavia.guzzo@univr.it symbol phone-number 045 802 7923
LucianiFabio

Luciani Fabio

Pezzotti Mario

symbol email mario.pezzotti@univr.it symbol phone-number +39045 802 7951

Polverari Annalisa

symbol email annalisa.polverari@univr.it symbol phone-number 045 8425629

Torriani Sandra

symbol email sandra.torriani@univr.it symbol phone-number 045 802 7921

Zapparoli Giacomo

symbol email giacomo.zapparoli@univr.it symbol phone-number +390458027047

Zoccatelli Gianni

symbol email gianni.zoccatelli@univr.it symbol phone-number +39 045 802 7952

Piano Didattico

Il piano didattico è l'elenco degli insegnamenti e delle altre attività formative che devono essere sostenute nel corso della propria carriera universitaria.
Selezionare il piano didattico in base all'anno accademico di iscrizione.

1° Anno

InsegnamentiCreditiTAFSSD

2° Anno  Attivato nell'A.A. 2004/2005

InsegnamentiCreditiTAFSSD

3° Anno  Attivato nell'A.A. 2005/2006

InsegnamentiCreditiTAFSSD

4° Anno  Attivato nell'A.A. 2006/2007

InsegnamentiCreditiTAFSSD
Laboratorio linguistico (inglese)
2
F
-

5° Anno  Attivato nell'A.A. 2007/2008

InsegnamentiCreditiTAFSSD
Legislazione europea delle biotecnologie e della biosicurezza
4
C
-
Metodologie biochimiche
4
B
-
Prova finale
50
E
-
InsegnamentiCreditiTAFSSD
Attivato nell'A.A. 2004/2005
InsegnamentiCreditiTAFSSD
Attivato nell'A.A. 2005/2006
InsegnamentiCreditiTAFSSD
Attivato nell'A.A. 2006/2007
InsegnamentiCreditiTAFSSD
Laboratorio linguistico (inglese)
2
F
-
Attivato nell'A.A. 2007/2008
InsegnamentiCreditiTAFSSD
Legislazione europea delle biotecnologie e della biosicurezza
4
C
-
Metodologie biochimiche
4
B
-
Prova finale
50
E
-
Insegnamenti Crediti TAF SSD
Tra gli anni: 4°- 5°Insegnamenti a scelta tra i seguenti per un totale di 8 crediti
Tra gli anni: 4°- 5°Insegnamenti a scelta tra i seguenti per un totale di 8 crediti
Tra gli anni: 4°- 5°A scelta dello studente. Si propongono tra le scelte possibili anche i seguenti insegnamenti. Tali insegnamenti sono di 8 crediti, tuttavia lo studente può concordare con il docente l'esame su un programma ridotto per l'acquisizione di un numero inferiore di crediti.

Legenda | Tipo Attività Formativa (TAF)

TAF (Tipologia Attività Formativa) Tutti gli insegnamenti e le attività sono classificate in diversi tipi di attività formativa, indicati da una lettera.




S Stage e tirocini presso imprese, enti pubblici o privati, ordini professionali

Codice insegnamento

4S00183

Crediti

3

Coordinatore

Alejandro Giorgetti

Lingua di erogazione

Italiano

Sede

VERONA

L'insegnamento è organizzato come segue:

Teoria

Crediti

2

Periodo

1° Sem

Sede

VERONA

Laboratorio

Crediti

1

Periodo

1° Sem

Sede

VERONA

Obiettivi formativi

Modulo: Teoria
-------
Il corso si pone l'obiettivo di fornire gli strumenti informatici per l'analisi e l'interpretazione dei dati biologici. Si propone inoltre di stabilire le basi teoriche delle possibili applicazioni dei principali strumenti bioinformatici di uso corrente in proteomica, genomica, biochimica, biologia molecolare e strutturale, mettendo lo studente in grado di utilizzare programmi di genomica funzionale, proteomica e genomica strutturale.


Modulo: Laboratorio
-------
Il laboratorio mira a fornire agli studenti gli strumenti e i metodi necessari per accedere all'informazione biologica in modo razionale ed efficiente, utilizzando le risorse disponibili in rete e programmi d'ultima generazione.

Programma

Modulo: Teoria
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Banche dati in ambito biologico. Le banche dati biologiche primarie, derivate e integrate. Il formato FASTA.


Allineamento di sequenze. Matrici di punteggio PAM e BLOSUM, penalizzazione di inserzioni e delezioni. Algoritmi di allineamento esatti ed euristici. Esempio di algoritmi di allineamento esatti: le matrici cumulative.

Allineamenti multipli. Il programma Clustal W. L’informazione strutturale contenuta negli allineamenti multipli. Profili di sequenza.

L’evoluzione delle proteine. Famiglie e superfamiglie proteiche. Ricerca in banche dati per similarità. Significatività dell’allineamento. I programmi FASTA, BLAST e PSI-BLAST.

Predizione della struttura tridimensionale di una proteina: Modelling comparativo. Relazione quantitativa per la conservazione della struttura primaria e terziaria in proteine omologhe. Il core proteico e le regioni strutturalmente divergenti (SDR). Passaggi per la costruzione di un modello comparativo. Librerie di rotameri. Modelling dei loop.

Calcoli energetici. Campi di forza per il calcolo dell’energia. Accenni ai metodi di minimizzazione energetica.

Qualità di una struttura proteica. Metodi statistici basati su parametri geometrici e di impacchettamento proteico. Applicazione al controllo di un modello proteico.

Predizione della struttura secondaria di una proteina. Proteine globulari: Metodo di Chou Fasman, Helical Wheel Analysis, reti neurali, modelli nascosti di Markov (HMM)

Predizione della struttura tridimensionale di una proteina: Fold recognition. Metodi basati sui profili, metodi di threading, metodi di mapping.

Predizione della struttura tridimensionale di una proteina: Ab initio. Metodi basati sull’assemblaggio di frammenti e potenziali knowledge-based (euristici).

Predizione della funzione proteica a partire dalla struttura. Database di famiglie e banche dati derivate. Classificazione di domini. Predizione di interazioni proteiche: BIND. Metodi knowledge-based per la predizione della funzione.

Ricerca di geni in banche dati. Annotazione di genomi procariotici ed eucariotici. Metodi statistici per la ricerca/annotazione di geni: matrici di punteggio sito-specifiche, Markov Models (MM). Sensibilità e specificità dei metodi. La banca dati ENSEMBL.
Analisi dell’espressione genica: Data mining di dati di espressione:
. estrazione ed analisi di dati da database biologici.
.Data mining di letteratura scientifica.
Progetto di sequenziamento del genoma umano e progetto ENCODE
Annotazione funzionale:
. Gene Ontology (GO).
. ENSEMBL
Microarray: Introduzione alle metodologie e studio delle tecniche per l’analisi dei dati


Modulo: Laboratorio
-------
Introduzione ai database in ambito biologico, loro struttura e metodologie di interrogazione.
Metodiche di allineamento di sequenze.
L’evoluzione delle proteine. L’informazione come misura dell’ordine di un sistema. L’informazione evolutiva. Famiglie e superfamiglie proteiche. Ricerca in banche dati per similarità. Significatività dell’allineamento. Riconoscimento di omologia. I programmi FASTA, BLAST e PSI-BLAST.

Predizione della struttura tridimensionale di una proteina: Modelling comparativo. Relazione quantitativa per la conservazione della struttura primaria e terziaria in proteine omologhe. Il core proteico e le regioni strutturalmente divergenti (SDR). Passaggi per la costruzione di un modello comparativo.

Controllo della qualità di una struttura proteica. Metodi statistici basati su parametri geometrici e di impacchettamento proteico. Applicazione al controllo di un modello proteico.

Predizione della struttura tridimensionale di una proteina: Fold recognition. Metodi basati sui profili, metodi di threading, metodi di mapping.

Predizione della struttura tridimensionale di una proteina: Ab initio. Metodi basati sull’assemblaggio di frammenti e potenziali knowledge-based (euristici).
Genomica:
Ricerca di geni in banche dati. Annotazione di genomi procariotici ed eucariotici. Metodi statistici per la ricerca/annotazione di geni: matrici di punteggio sito-specifiche, Markov Models (MM). Sensibilità e specificità dei metodi. La banca dati ENSEMBL.
Analisi dell’espressione genica: Data mining di dati di espressione:
. estrazione ed analisi di dati da database biologici.
. Data mining di letteratura scientifica.
Progetto di sequenziamento del genoma umano e progetto ENCODE
Annotazione funzionale:
. Gene Ontology (GO).
. geni ortologhi: loro funzione nell’annotazione funzionale.
Microarray: Introduzione alle metodologie e studio delle tecniche per l’analisi dei dati

Modalità d'esame

Modulo: Teoria
-------
scritto


Modulo: Laboratorio
-------
Scritto

Le/gli studentesse/studenti con disabilità o disturbi specifici di apprendimento (DSA), che intendano richiedere l'adattamento della prova d'esame, devono seguire le indicazioni riportate QUI

Tipologia di Attività formativa D e F

Documenti e avvisi

Anno accademico:

Insegnamenti non ancora inseriti

Prospettive


Avvisi degli insegnamenti e del corso di studio

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