Obiettivi di apprendimento

Fornire ai dottorandi una visione integrata e avanzata del ruolo del microbiota orale nei processi oncologici, permettendo loro di collegare la dimensione clinica con quella molecolare e sperimentale, e di riconoscere le prospettive future nella ricerca e nella traslazione clinica.

Prerequisiti e nozioni di base

Conoscenze di base di microbiologia generale e microbiologia orale. Nozioni fondamentali di biologia molecolare e genomica. Comprensione dei meccanismi di carcinogenesi e dei processi infiammatori. Principi generali di immunologia.
Competenze tecniche consigliate: Familiarità con tecniche di sequenziamento e concetti di metagenomica. Nozioni di base di analisi bioinformatica. Capacità di lettura critica di articoli scientifici peer-reviewed.
Competenze trasversali Saper discutere dati sperimentali e impostare un’ipotesi di ricerca. Capacità di comunicazione orale per la discussione dei paper. Conoscenze metodologiche minime su disegno di studi clinici e sperimentali.

Programma

Introduzione al Microbiota Orale. Definizione e composizione del microbiota del cavo orale. Distinzione tra microbiota commensale, opportunista e patogeno. Ecologia microbica orale: biofilm, nicchie ecologiche, stabilità/dinamiche. Tecnologie per lo studio del microbiota orale. Metodi colturali e limiti. Metodiche “omics”: Metagenomica 16S rRNA Shotgun metagenomics. Trascrittomica e metabolomica Bioinformatica e analisi dei big data microbiologici. Microbiota e immunologia del cavo orale. Interazione microbiota–ospite. Immunità mucosa orale. Meccanismi di infiammazione cronica e immunomodulazione e limiti delle tecnologie attuali. Microbiota orale e cancerogenesi: evidenze biologiche e molecolari. Ruolo dei batteri nella carcinogenesi: Infiammazione cronica. Produzione di metaboliti tossici o genotossici. Modificazione dell’epigenoma e del ciclo cellulare. Focus su microrganismi associati al rischio oncologico: Fusobacterium nucleatum. Porphyromonas gingivalis. Treponema denticola. Altri taxa emergenti. Microbiota e cancro del cavo orale, esofago, pancreas e colon: overview delle evidenze attuali. Microbiota orale come biomarcatore oncologico. Profilazione microbica per la diagnosi precoce. Microbiota salivare come strumento non invasivo. Sensibilità, specificità e criticità dei biomarkers. Dalla clinica alla ricerca: modelli sperimentali e trial. Studi longitudinali sul microbiota: design, bias, confounding factors. Microbiota e risposta ai trattamenti oncologici: chemio, radio e immunoterapia. Esempi di protocolli clinici in cui il microbiota orale è variabile sperimentale o outcome. Applicazioni terapeutiche emergenti. Modulazione del microbiota: probiotici, prebiotici, postbiotici, trapianto di microbiota orale. Approcci antimicrobici selettivi (bacteriocine, CRISPR antimicrobiche). Potenziali applicazioni in prevenzione e supporto terapeutico oncologico. Discussione finale e presentazione di paper recenti. Journal club guidato su 2–3 articoli ad alto impatto. Discussione critica sulle prospettive future della ricerca. Identificazione delle principali domande aperte nel campo.

Bibliografia

Modalità didattiche

modalità didattica mista frontale in presenza e da remoto con discussione interattiva

Modalità di verifica dell'apprendimento

orale

Valutazione

Criteri di Valutazione dell’Esame Orale
Conoscenza e comprensione dei contenuti. Accuratezza nella descrizione dei concetti fondamentali. Capacità di integrare aspetti microbiologici, immunologici e oncologici. Comprensione delle tecnologie “omics” e dei loro limiti. Capacità di analisi critica. Valutazione critica degli studi scientifici discussi. Capacità di commentare evidenze, punti di forza e limiti metodologici. Utilizzo appropriato del ragionamento scientifico nell’interpretazione dei dati. Capacità di applicazione e problem solving. Capacità di collegare conoscenze teoriche a scenari clinici o di ricerca. Abilità nel proporre ipotesi sperimentali o interpretazioni plausibili. Comprensione delle implicazioni traslazionali del microbiota orale in oncologia.
Chiarezza espositiva e rigore terminologico Organizzazione logica della risposta. Uso corretto della terminologia scientifica. Capacità di comunicazione efficace e appropriata al livello dottorale. Partecipazione attiva durante il corso / journal club
Contributi pertinenti alle discussioni. Capacità di presentare e discutere articoli ad alto impatto. Impegno nelle attività di analisi critica.

Criteri di composizione del voto finale

in tretesimi