Studiare

In questa sezione è possibile reperire le informazioni riguardanti l'organizzazione pratica del corso, lo svolgimento delle attività didattiche, le opportunità formative e i contatti utili durante tutto il percorso di studi, fino al conseguimento del titolo finale.

A.A. 2017/2018

Calendario accademico

Il calendario accademico riporta le scadenze, gli adempimenti e i periodi rilevanti per la componente studentesca, personale docente e personale dell'Università. Sono inoltre indicate le festività e le chiusure ufficiali dell'Ateneo.
L’anno accademico inizia il 1° ottobre e termina il 30 settembre dell'anno successivo.

Calendario accademico

Calendario didattico

Il calendario didattico indica i periodi di svolgimento delle attività formative, di sessioni d'esami, di laurea e di chiusura per le festività.

Definizione dei periodi di lezione
Periodo Dal Al
I sem. 2-ott-2017 31-gen-2018
II sem. 1-mar-2018 15-giu-2018
Sessioni degli esami
Sessione Dal Al
Sessione invernale d'esami 1-feb-2018 28-feb-2018
Sessione estiva d'esame 18-giu-2018 31-lug-2018
Sessione autunnale d'esame 3-set-2018 28-set-2018
Sessioni di lauree
Sessione Dal Al
Sessione Estiva Lauree Magistrali 19-lug-2018 19-lug-2018
Sessione Autunnale Lauree Magistrali 18-ott-2018 18-ott-2018
Sessione Invernale Lauree Magistrali 21-mar-2019 21-mar-2019
Vacanze
Periodo Dal Al
Vacanze di Natale 22-dic-2017 7-gen-2018
Vacanze di Pasqua 30-mar-2018 3-apr-2018
Festa del Santo Patrono - S. Zeno 21-mag-2018 21-mag-2018
Vacanze estive 6-ago-2018 19-ago-2018

Calendario esami

Gli appelli d'esame sono gestiti dalla Unità Operativa Didattica e Studenti Scienze e Ingegneria.
Per consultazione e iscrizione agli appelli d'esame visita il sistema ESSE3.
Per problemi inerenti allo smarrimento della password di accesso ai servizi on-line si prega di rivolgersi al supporto informatico della Scuola o al servizio recupero credenziali

Calendario esami

Per dubbi o domande leggi le risposte alle domande più frequenti F.A.Q. Iscrizione Esami

Docenti

A B C D F G L M P S

Accordini Simone

simone.accordini@univr.it +39 045 8027657

Belussi Alberto

alberto.belussi@univr.it +39 045 802 7980

Bicego Manuele

manuele.bicego@univr.it +39 045 802 7072
Foto,  9 febbraio 2017

Bloisi Domenico Daniele

domenico.bloisi@univr.it

Bombieri Cristina

cristina.bombieri@univr.it 045-8027209

Bombieri Nicola

nicola.bombieri@univr.it +39 045 802 7094

Boscaini Maurizio

maurizio.boscaini@univr.it

Busato Federico

federico.busato@univr.it

Calanca Andrea

andrea.calanca@univr.it +39 045 802 7847

Cicalese Ferdinando

ferdinando.cicalese@univr.it +39 045 802 7969

Combi Carlo

carlo.combi@univr.it 045 802 7985

Constantin Gabriela

gabriela.constantin@univr.it 045-8027102

Daducci Alessandro

alessandro.daducci@univr.it +39 045 8027025

Delledonne Massimo

massimo.delledonne@univr.it 045 802 7962; Lab: 045 802 7058

Franco Giuditta

giuditta.franco@univr.it +39 045 802 7045

Giugno Rosalba

rosalba.giugno@univr.it 0458027066

Laudanna Carlo

carlo.laudanna@univr.it 045-8027689

Liptak Zsuzsanna

zsuzsanna.liptak@univr.it +39 045 802 7032

Malerba Giovanni

giovanni.malerba@univr.it 045/8027685

Marcon Alessandro

alessandro.marcon@univr.it +39 045 802 7668

Maris Bogdan Mihai

bogdan.maris@univr.it +39 045 802 7074

Menegaz Gloria

gloria.menegaz@univr.it +39 045 802 7024

Perduca Massimiliano

massimiliano.perduca@univr.it +39 045 802 7984

Sala Pietro

pietro.sala@univr.it 0458027850

Salvagno Gian Luca

gianluca.salvagno@univr.it 045 8124308-0456449264

Piano Didattico

Il piano didattico è l'elenco degli insegnamenti e delle altre attività formative che devono essere sostenute nel corso della propria carriera universitaria.
Selezionare il piano didattico in base all'anno accademico di iscrizione.

InsegnamentiCreditiTAFSSD
One course to be chosen among the following
6
C
(MED/04)
Two courses to be chosen among the following
6
C
(BIO/18)
6
C
(BIO/13 ,MED/03)
InsegnamentiCreditiTAFSSD
Final exam
24
E
-

1° Anno

InsegnamentiCreditiTAFSSD
One course to be chosen among the following
6
C
(MED/04)
Two courses to be chosen among the following
6
C
(BIO/18)
6
C
(BIO/13 ,MED/03)

2° Anno

InsegnamentiCreditiTAFSSD
Final exam
24
E
-
Insegnamenti Crediti TAF SSD
Tra gli anni: 1°- 2°
Tra gli anni: 1°- 2°
Tra gli anni: 1°- 2°
Other activities
2
F
-

Legenda | Tipo Attività Formativa (TAF)

TAF (Tipologia Attività Formativa) Tutti gli insegnamenti e le attività sono classificate in diversi tipi di attività formativa, indicati da una lettera.




SStage e tirocini presso imprese, enti pubblici o privati, ordini professionali

Codice insegnamento

4S004548

Coordinatore

Rosalba Giugno

Crediti

12

Settore Scientifico Disciplinare (SSD)

INF/01 - INFORMATICA

Lingua di erogazione

Inglese en

Periodo

II sem., I sem.

Obiettivi formativi

Il corso ha l’obiettivo di fornire gli strumenti di programmazione necessari per l’analisi di dati genomici, trascrittomici e proteomici provenienti dalle tecnologie di ultima generazione. Per ogni argomento sono previste lezioni teoriche e di seguito (stesso giorno o giorni seguenti secondo il calendario) esercitazione in laboratorio.
A completamento del corso gli studenti saranno in grado di programmare, secondo i dati da analizzare e la domanda biomedica da risolvere, la pipeline di analisi appropriata. Sapranno altresì interpretare i dati e i risultati ottenuti.

Programma

Programmare in R. Introduzione. Le Strutture dati: Vettori, Matrici, Liste, Data Frame. Data Frame. Le funzioni. In/Out. Visualizzazione, la grammatica di graphics e ggplot2.

Capire e usare la Statistica: Pvalue, FDR, median, MAD, rank test, Spearman, test multiple e modelli lineari.

Programmare con Bioconductor. Struttura, principi e funzione. Allineamento di sequenze, progettazione sperimentale, effetti batch, analisi dei dati RNA-Seq e espressione differenziale, analisi di metilazione, analisi CNV, analisi di Microarray. Risorse di annotazione, Arricchimento funzionale.

Programmazione in Python e Bash. Introduzione e principi di base.

Algoritmi di analisi avanzati. Clustering e classificazione, resampling, cross-validation, bootstrap e test di permutazione, reti biologiche e loro analisi.

Il materiale didattico (principalmente basato su articoli scientifici continuamente aggiornati e guide online alla programmazione) è disponile nella piattaforma e-learning di Ateneo relativa al corso.

Bibliografia

Testi di riferimento
Autore Titolo Casa editrice Anno ISBN Note
Rafael A Irizarry and Michael I Love Data Analysis for the Life Sciences https://leanpub.com/dataanalysisforthelifesciences/ 2015

Modalità d'esame

L’esame consiste di una parte scritta (A) e di una progettuale (B). A consiste nello sviluppo di un programma in R per la risoluzione di un problema su dati genomici, trascrittomici o proteomici. B consiste nello sviluppo di un progetto concordato con il docente previo richiesta via email e appuntamento per l’elaborazione delle specifiche (il progetto ha validità tutto l’anno accademico). I progetti hanno diversi livelli di difficoltà. Ad ogni difficoltà corrisponde un valore massimo di valutazione. Gli studenti sosteranno un colloquio per commentare e approfondire le prove sostenute (A e B).

Riguardo al punto A, i frequentanti al corso potranno partecipare a due prove intermedie previste durante l’anno. Le prove consistono nello sviluppo di un programma in R per l'analisi di dati biomedici. Le due prove avranno un voto cumulativo espresso in trentesimi e comunicato agli studenti alla fine del corso.

Riguardo al punto B, i frequentanti al corso potranno potranno esporre alla classe le tematiche del loro progetto, il contesto di ricerca in cui il progetto è collocato, e lo stato di avanzamento dello stesso.

Il voto per le parti A e B è espresso in trentesimi.

Il voto finale è calcolato come min(31, ((A+B)/2)+C).
C è espresso nell'intervallo[-4,+4] è riflette la maturazione e autonomia scientifica acquisita durante lo sviluppo delle prove e del progetto, nell’esposizione e nell’interpretazione della letteratura scientifica e del contesto scientifico del progetto.

Tipologia di Attività formativa D e F

Insegnamenti non ancora inseriti