Studying at the University of Verona
Here you can find information on the organisational aspects of the Programme, lecture timetables, learning activities and useful contact details for your time at the University, from enrolment to graduation.
Type D and Type F activities
This information is intended exclusively for students already enrolled in this course.If you are a new student interested in enrolling, you can find information about the course of study on the course page:
Laurea magistrale in Biotecnologie per le biorisorse e lo sviluppo ecosostenibile - Enrollment from 2025/2026Le attività formative di tipologia D sono a scelta dello studente, quelle di tipologia F sono ulteriori conoscenze utili all’inserimento nel mondo del lavoro (tirocini, competenze trasversali, project works, ecc.). In base al Regolamento Didattico del Corso, alcune attività possono essere scelte e inserite autonomamente a libretto, altre devono essere approvate da apposita commissione per verificarne la coerenza con il piano di studio. Le attività formative di tipologia D o F possono essere ricoperte dalle seguenti attività.
1. Insegnamenti impartiti presso l'Università di Verona
Comprendono gli insegnamenti sotto riportati e/o nel Catalogo degli insegnamenti (che può essere filtrato anche per lingua di erogazione tramite la Ricerca avanzata).
Modalità di inserimento a libretto: se l'insegnamento è compreso tra quelli sottoelencati, lo studente può inserirlo autonomamente durante il periodo in cui il piano di studi è aperto; in caso contrario, lo studente deve fare richiesta alla Segreteria, inviando a carriere.scienze@ateneo.univr.it il modulo nel periodo indicato.
2. Attestato o equipollenza linguistica CLA
Oltre a quelle richieste dal piano di studi, per gli immatricolati dall'A.A. 2021/2022 vengono riconosciute:
- Lingua inglese: vengono riconosciuti 3 CFU per ogni livello di competenza superiore a quello richiesto dal corso di studio (se non già riconosciuto nel ciclo di studi precedente).
- Altre lingue e italiano per stranieri: vengono riconosciuti 3 CFU per ogni livello di competenza a partire da A2 (se non già riconosciuto nel ciclo di studi precedente).
Tali cfu saranno riconosciuti, fino ad un massimo di 6 cfu complessivi, di tipologia F se il piano didattico lo consente, oppure di tipologia D. Ulteriori crediti a scelta per conoscenze linguistiche potranno essere riconosciuti solo se coerenti con il progetto formativo dello studente e se adeguatamente motivati.
Gli immatricolati fino all'A.A. 2020/2021 devono consultare le informazioni che si trovano qui.
Modalità di inserimento a libretto: richiedere l’attestato o l'equipollenza al CLA e inviarlo alla Segreteria Studenti - Carriere per l’inserimento dell’esame in carriera, tramite mail: carriere.scienze@ateneo.univr.it
Attenzione: agli studenti, che hanno conseguito il livello B2 d’inglese nelle loro carriere triennali, si sottolinea la necessità di sostituire il livello B2 d’inglese completo, previsto dal piano didattico, con il livello C1 informatizzato d’inglese oppure di acquisire altra competenza linguistica in una lingua comunitaria almeno di livello B1 completo.
3. Competenze trasversali
Scopri i percorsi formativi promossi dal TALC - Teaching and learning center dell'Ateneo, destinati agli studenti regolarmente iscritti all'anno accademico di erogazione del corso https://talc.univr.it/it/competenze-trasversali
Modalità di inserimento a libretto: non è previsto l'inserimento dell'insegnamento nel piano di studi. Solo in seguito all'ottenimento dell'Open Badge verranno automaticamente convalidati i CFU a libretto. La registrazione dei CFU in carriera non è istantanea, ma ci saranno da attendere dei tempi tecnici.
4. Contamination lab
Il Contamination Lab Verona (CLab Verona) è un percorso esperienziale con moduli dedicati all'innovazione e alla cultura d'impresa che offre la possibilità di lavorare in team con studenti e studentesse di tutti i corsi di studio per risolvere sfide lanciate da aziende ed enti. Il percorso permette di ricevere 6 CFU in ambito D o F. Scopri le sfide: https://www.univr.it/clabverona
ATTENZIONE: Per essere ammessi a sostenere una qualsiasi attività didattica, incluse quelle a scelta, è necessario essere iscritti all'anno di corso in cui essa viene offerta. Si raccomanda, pertanto, ai laureandi delle sessioni di dicembre e aprile di NON svolgere attività extracurriculari del nuovo anno accademico, cui loro non risultano iscritti, essendo tali sessioni di laurea con validità riferita all'anno accademico precedente. Quindi, per attività svolte in un anno accademico cui non si è iscritti, non si potrà dar luogo a riconoscimento di CFU.
Insegnamenti e altre attività che si possono inserire autonomamente a libretto valide per l'a.a. 2024/25
| years | Modules | TAF | Teacher |
|---|---|---|---|
| 2° | Python programming language [English edition] | D |
Carlo Combi
(Coordinator)
|
| years | Modules | TAF | Teacher |
|---|---|---|---|
| 2° | Python programming language [Edizione in italiano] | D |
Carlo Combi
(Coordinator)
|
Bioinformatics (2024/2025)
Teaching code
4S00183
Teacher
Coordinator
Credits
6
Language
Italian
Scientific Disciplinary Sector (SSD)
BIO/11 - MOLECULAR BIOLOGY
Period
Semester 1 dal Oct 1, 2024 al Jan 31, 2025.
Courses Single
Authorized with reserve
Learning objectives
Over the last decade the technological improvements of sequencing technologies (Next Generation Sequencing, NGS) had an enormous impact on the understanding of the genomes complexity and had provided interesting opportunities for the development of bioinformatics tools and programs for data analysis and management. The course aims to provide a general overview of the different computational methods applied in the field of NGS and omics science. These new technologies, which made possible to move from a reductionist to a holistic approach, have made it necessary to develop new strong interdisciplinary methods for data interpretation and integration. The course will provide students with basic knowledge on bioinformatics tools for the interpretation and integration of different omics data applied to the study of genomes, of gene expression and of metagenomic data for community analysis and microbial characterization. The course will also include a part performed in a computer lab where the computational programs necessary for the manipulation and interpretation of biological data will be illustrated.
Prerequisites and basic notions
No specific prerequisites are required. Basic knowledge of bioinformatics (e.g. sequence alignment) may be helpful but is not essential to better understand the program.
Program
1. Introduction to next-generation sequencing (NGS) data
2. Genome assembly
3. Alignment of NGS data to a reference genome
4. Genome analysis
a. Gene prediction and annotation
5. Analysis of transcriptomic and RNA-seq data
a. Gene quantification
b. Data normalization
c. Identification of differentially expressed genes
6. Comparative genomics
a. Pangenome construction
b. Resequencing and variant calling
7. Metagenomics
a. Metabarcoding
i. Marker genes
ii. Sample inference
iii. Taxonomic assignment
b. Whole metagenome sequencing
i. Assembly
ii. Binning
iii. Annotation
c. Metatranscriptomics
d. Data analysis
i. Ecological metrics
ii. Differential abundance
Didactic methods
The teaching methods adopted in the course are:
- Frontal lessons
- Computer laboratory exercises
- Reading and presentation of scientific articles
Learning assessment procedures
The exam consists of a written verification of the level of knowledge regarding the argument of the course. The exam consist of six open questions. The student need to demonstrate the understanding of the method and application of the major bioinformatic programs and approaches learned during the course.
Evaluation criteria
The level of understanding of the topics and the language properties will be evaluated
Criteria for the composition of the final grade
Each question will be assigned a score of 10, the final grade will be scaled to 31. A grade higher than 30.5 will be awarded honors. The activity of presenting scientific articles is not mandatory, students who intend to present a scientific article may have a bonus of up to two points to add to the exam grade
Exam language
Italiano
