Studiare
In questa sezione è possibile reperire le informazioni riguardanti l'organizzazione pratica del corso, lo svolgimento delle attività didattiche, le opportunità formative e i contatti utili durante tutto il percorso di studi, fino al conseguimento del titolo finale.
Piano Didattico
Queste informazioni sono destinate esclusivamente agli studenti e alle studentesse già iscritti a questo corso.Se sei un nuovo studente interessato all'immatricolazione, trovi le informazioni sul percorso di studi alla pagina del corso:
Laurea magistrale in Molecular and Medical Biotechnology - Immatricolazione dal 2025/2026Il piano didattico è l'elenco degli insegnamenti e delle altre attività formative che devono essere sostenute nel corso della propria carriera universitaria.
Selezionare il piano didattico in base all'anno accademico di iscrizione.
1° Anno
Insegnamenti | Crediti | TAF | SSD |
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Due insegnamenti a scelta
Un insegnamento a scelta
Tre insegnamenti a scelta
Un insegnamento a scelta
2° Anno Attivato nell'A.A. 2017/2018
Insegnamenti | Crediti | TAF | SSD |
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Due insegnamenti a scelta
Insegnamenti | Crediti | TAF | SSD |
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Due insegnamenti a scelta
Un insegnamento a scelta
Tre insegnamenti a scelta
Un insegnamento a scelta
Insegnamenti | Crediti | TAF | SSD |
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Due insegnamenti a scelta
Legenda | Tipo Attività Formativa (TAF)
TAF (Tipologia Attività Formativa) Tutti gli insegnamenti e le attività sono classificate in diversi tipi di attività formativa, indicati da una lettera.
Programming for genomics (2016/2017)
Codice insegnamento
4S003671
Docente
Coordinatore
Crediti
6
Lingua di erogazione
Inglese
Settore Scientifico Disciplinare (SSD)
MED/03 - GENETICA MEDICA
Periodo
I sem. dal 3 ott 2016 al 31 gen 2017.
Obiettivi formativi
The course aims to provide the core skills to manage “big data” in the genomics era.
The course will focus on R programming, basic scripting and data processing.
At the end of the course, the student will know the basics on how to use the main command-line tools for files and strings handling within the context of genomics such as DNA sequence files and pedigree files containing information on individual genotypes.
Programma
Specifically we aim to furnish the knowledge to:
- work into a Linux environment and bash scripting
- use R and its libraries for bioinformatic analyses (Bioconductor project)
- collect and collate genetic data from diverse sources
- arranging directories, renaming and archiving files
- convert files from one format into another
- prepare pipelines of commands for repetitive tasks (for instance, same analyses over more samples)
- learn the fundamentals of Perl and Python programming (hacking pre-existing programs to accomplish novel tasks)
The topics will be illustrated using real-life bioinformatic case studies (for instance, GWAS, exome or transcriptome analyses)
Autore | Titolo | Casa editrice | Anno | ISBN | Note |
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Arnold Robbins, Nelson H. F. Beebe | Classic Shell Scripting: Hidden Commands that Unlock the Power of Unix | O'Reilly Media | 2005 | 0596005954 |
Modalità d'esame
L'esame consiste nel verificare la comprensione dei contenuti del corso e la capacità di descrivere con proprietà di linguaggio i vari argomenti.
Le modalità dell'esame sono le stesse sia per gli studenti che hanno frequentato che per quelli che non hanno frequentato il corso.
L'esame consiste in una prova orale che verificherà la conoscenza dei contenuti del corso.
L'esame sarà superato quando lo studente otterrà un punteggio superiore o uguale ai 18/30 .