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L'insegnamento è organizzato come segue:

Obiettivi formativi

La genomica e la trascrittomica rappresentano le frontiere della ricerca genetica moderna, sono caratterizzate da altissima complessità tecnica derivante dall’utilizzazione di speciali strumentazioni in grado di produrre una immensa quantità di dati in un tempo sperimentale relativamente breve. La loro utilizzazione per la comprensione dei fenomeni biologici attraverso la visone globale della struttura e della funzione del genoma si sta diffondendo capillarmente in numerose discipline , dalla medicina alla biologia sperimentale passando per l’agricoltura.
Questo corso si propone di illustrare in maniera approfondita gli aspetti tecnologici della genomica e della trascrittomica teoricamente con il confronto delle differenti metodologie attualmente in uso e praticamente realizzando un reale esperimento di analisi di espressione genica globale attraverso l’uso di differenti piattaforme di microarray.

Programma

Teoria
La genomica e suoi strumenti
La trascrittomica e i suoi strumenti.
Confronto delle piattaforme di trascrittomica
Vantaggi e svantaggi delle differenti piattaforme di trascrittomica.



Laboratorio

Estrazione dell’RNA da tessuti vegetali
Controllo della qualità dell’RNA al bioanalyzer
Marcatura dell’RNA con due differenti protocolli (Combimatrix e NimbleGen).
Ibridazione di due differenti microarrays (Combimatix e NimbleGen)
Scanning dei microarray al lettore confocale laser
Estrazione ed analisi dei dati

Modalità d'esame

Valutazione del grado di preparazione mediante colloquio