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In questa sezione è possibile reperire le informazioni riguardanti l'organizzazione pratica del corso, lo svolgimento delle attività didattiche, le opportunità formative e i contatti utili durante tutto il percorso di studi, fino al conseguimento del titolo finale.
Tipologia di Attività formativa D e F
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Laurea magistrale in Molecular and Medical Biotechnology - Immatricolazione dal 2025/2026Insegnamenti non ancora inseriti
Computational biology (2018/2019)
Codice insegnamento
4S003658
Crediti
6
Lingua di erogazione
Inglese
Offerto anche nei corsi:
- Bioinformatica ed ingegneria proteica - INGEGNERIA PROTEICA del corso Laurea magistrale in Biotecnologie agro-alimentari [LM-7]
- Bioinformatica ed ingegneria proteica - BIOINFORMATICA del corso Laurea magistrale in Biotecnologie agro-alimentari [LM-7]
Settore Scientifico Disciplinare (SSD)
BIO/10 - BIOCHIMICA
L'insegnamento è organizzato come segue:
Modulo 2
Modulo 1
Obiettivi formativi
Questo corso fornisce un'introduzione alle moderne tecniche della biologia molecolare computazionale e al disegno razionale di proteine attraverso il PC. Gli argomenti trattati riguardano sopratutto le tecniche di simulazione di dinamica molecolare e concetti avanzati di bioinformatica strutturale.
Al termine dell’insegnamento lo studente dovrà dimostrare di essere in grado di
- capire in profondità un articolo scientifico in cui tecniche computazionali vengono utilizzati
- Introdurre (in silico) mutanti per modificare la struttura/funzione di una proteina
- Preparare il sistema e girare simulazioni di dinamica molecolare utilizzando programmi allo stato dell'arte
Programma
Parte A – Bioinformatica
− Bioinformatica strutturale avanzata.
- Basi termodinamiche della stabilità di strutture biomolecolari.
− Molecular basis of human perception
Part B – Modellizzazione Molecolare
− Nozioni basiche
− Campi di forza
- Simulazioni di dinamica molecolare: Gromacs
− Conformational analysis
Part C – Interazione delle proteine con i partner cellulari.
− Complessi proteina-pr, proteina-piccole molecole: Algoritmi e programmi principali.
− Progetto: Drug and/or protein design
Bibliografia
| Attività | Autore | Titolo | Casa editrice | Anno | ISBN | Note |
|---|---|---|---|---|---|---|
| Modulo 2 | Stefano Pascarella e Alessandro Paiardini | Bioinformatica | Zanichelli | 2011 | 9788808062192 | |
| Modulo 1 | Stefano Pascarella e Alessandro Paiardini | Bioinformatica | Zanichelli | 2011 | 9788808062192 | |
| Modulo 1 | Frishman, D., Valencia, Alfonso | Modern Genome Annotation | Springer | 2008 |
Modalità d'esame
Scritto.
L'esame è diviso in una parte di presentazione di un articolo in cui vengono utilizzate tecniche allo stato dell'arte nel campo della biologia computazionale.
La seconda parte riguarda un esame scritto con domande aperte sugli argomenti trattati durante il corso.
