Studiare
In questa sezione è possibile reperire le informazioni riguardanti l'organizzazione pratica del corso, lo svolgimento delle attività didattiche, le opportunità formative e i contatti utili durante tutto il percorso di studi, fino al conseguimento del titolo finale.
Piano Didattico
Queste informazioni sono destinate esclusivamente agli studenti e alle studentesse già iscritti a questo corso. Se sei un nuovo studente interessato all'immatricolazione, trovi le informazioni sul percorso di studi alla pagina del corso:
Laurea in Biotecnologie - Immatricolazione dal 2025/2026.Il piano didattico è l'elenco degli insegnamenti e delle altre attività formative che devono essere sostenute nel corso della propria carriera universitaria.
Selezionare il piano didattico in base all'anno accademico di iscrizione.
1° Anno
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2° Anno Attivato nell'A.A. 2020/2021
| Insegnamenti | Crediti | TAF | SSD |
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3° Anno Attivato nell'A.A. 2021/2022
| Insegnamenti | Crediti | TAF | SSD |
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Un insegnamento a scelta | Insegnamenti | Crediti | TAF | SSD |
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Un insegnamento a scelta Legenda | Tipo Attività Formativa (TAF)
TAF (Tipologia Attività Formativa) Tutti gli insegnamenti e le attività sono classificate in diversi tipi di attività formativa, indicati da una lettera.
Bioinformatica e banche dati biologiche (2020/2021)
Codice insegnamento
4S02701
Crediti
6
Lingua di erogazione
Italiano
Settore Scientifico Disciplinare (SSD)
BIO/10 - BIOCHIMICA
L'insegnamento è organizzato come segue:
Mod. 2
Mod. 1
Obiettivi formativi
Il corso si propone di introdurre lo studente alla bioinformatica, fornendo nozioni di base principalmente orientate all’analisi di sequenze sia nucleotidiche che proteiche. Verranno fornite le basi sia teoriche che pratiche dell’uso di algoritmi, programmi e metodi per la ricerca e l’analisi dei dati di sequenza contenuti nelle banche dati biologiche. A completamento del corso, gli studenti saranno in grado di: - Orientarsi tra le diverse banche dati biologiche e sapere dove reperire le informazioni - Analizzare dati di sequenza mediante ricerche di similarità in banca dati - Confrontare, gestire ed analizzare dati di sequenza utilizzando differenti tipi di programmi per l'allineamento di sequenze
Programma
L'insegnamento si articola in due moduli, uno teorico e uno più pratico che si svolge mediante delle esercitazioni direttamente al computer. Gli argomenti trattati dai due moduli sono gli stessi, permettendo agli studenti di mettere in pratica le nozioni che verranno studiate da un punto di vista teorico.
1. Introduzione alla bioinformatica
2. Banche dati biologiche: banche dati primarie e secondarie, metodi di ricerca in banca dati
3. Matrici di sostituzione PAM e BLOSUM
4. Introduzione all’allineamento tra sequenze: dot matrix, algoritmi basati su programmazione dinamica (Smith-Watermann, Needlman-Wunsch), programmi euristici (BLAST e FASTA)
5. Allineamenti multipli: introduzione ai diversi approcci algoritmici, uso e funzionamento dei programm ClustalW, T-Coffee. Utilizzo degli allineamenti multipli per la generazione di matrici posizionali di peso, uso di PSI-BLAST, metodi basati su Hidden Markov Model (HMM)
6. Introduzione all’analisi filogenetica e alberi filogenetici
7. Biologia strutturale: struttura delle proteine e metodi computazionali per lo studio delle strutture secondarie e terziarie delle proteine.
Modalità d'esame
L'esame verte sia sulla parte teorica (modulo 1) che sulla parte di esercitazione svolta in laboratorio (modulo 2).
Entrambe le parti saranno valutate durante un unico esame.
L'esame sulla parte di teoria consiste in una verifica scritta (tipicamente 4 domande aperte) che mira a verificare il livello di conoscenze acquisite relativo agli argomenti trattati nel corso.
Lo studente dovrà dimostrare di aver compreso il funzionamento e l'applicazione dei principali programmi e approcci bioinformatici spiegati a lezione.
La parte relativa alle esercitazione sarà svolta al computer subito dopo la prova scritta. Verranno forniti due esercizi che da risolvere mettendo in pratica le competenze acquisite durante il laboratorio. Lo studente dovrà inoltre dimostrare di saper interpretare il risultato dei programmi studiati durante il corso.
