Studiare
In questa sezione è possibile reperire le informazioni riguardanti l'organizzazione pratica del corso, lo svolgimento delle attività didattiche, le opportunità formative e i contatti utili durante tutto il percorso di studi, fino al conseguimento del titolo finale.
Calendario accademico
Il calendario accademico riporta le scadenze, gli adempimenti e i periodi rilevanti per la componente studentesca, personale docente e personale dell'Università. Sono inoltre indicate le festività e le chiusure ufficiali dell'Ateneo.
L’anno accademico inizia il 1° ottobre e termina il 30 settembre dell'anno successivo.
Calendario didattico
Il calendario didattico indica i periodi di svolgimento delle attività formative, di sessioni d'esami, di laurea e di chiusura per le festività.
| Periodo | Dal | Al |
|---|---|---|
| I semestre | 1-ott-2012 | 31-gen-2013 |
| II semestre | 4-mar-2013 | 14-giu-2013 |
| Sessione | Dal | Al |
|---|---|---|
| Sessione straordinaria | 4-feb-2013 | 28-feb-2013 |
| Sessione estiva | 17-giu-2013 | 31-lug-2013 |
| Sessione autunnale | 2-set-2013 | 30-set-2013 |
| Sessione | Dal | Al |
|---|---|---|
| Sessione autunnale | 10-ott-2012 | 10-ott-2012 |
| Sessione straordinaria | 13-dic-2012 | 13-dic-2012 |
| Sessione invernale | 13-mar-2013 | 13-mar-2013 |
| Sessione estiva | 17-lug-2013 | 17-lug-2013 |
| Periodo | Dal | Al |
|---|---|---|
| Festa di Ognissanti | 1-nov-2012 | 1-nov-2012 |
| Festa dell'Immacolata Concezione | 8-dic-2012 | 8-dic-2012 |
| Vacanze di Natale | 21-dic-2012 | 6-gen-2013 |
| Vacanze di Pasqua | 29-mar-2013 | 2-apr-2013 |
| Festa della Liberazione | 25-apr-2013 | 25-apr-2013 |
| Festa del Lavoro | 1-mag-2013 | 1-mag-2013 |
| Festa del Santo Patrono di Verona - San Zeno | 21-mag-2013 | 21-mag-2013 |
| Festa della Repubblica | 2-giu-2013 | 2-giu-2013 |
| Vacanze estive | 9-ago-2013 | 16-ago-2013 |
Calendario esami
Gli appelli d'esame sono gestiti dalla Unità Operativa Didattica e Studenti Scienze e Ingegneria.
Per consultazione e iscrizione agli appelli d'esame visita il sistema ESSE3.
Per problemi inerenti allo smarrimento della password di accesso ai servizi on-line si prega di rivolgersi al supporto informatico della Scuola o al servizio recupero credenziali
Per dubbi o domande leggi le risposte alle domande più frequenti F.A.Q. Iscrizione Esami
Docenti
Cecchi Franco
franco.cecchi@univr.it 045 802 7964 - 7965
Marastoni Corrado
maraston@math.unipd.it
Monaco Ugo Luigi
hugo.monaco@univr.it 045 802 7903; Lab: 045 802 7907 - 045 802 7082
Spena Angelo
angelo.spena@univr.it 045 683 5623
Vallini Giovanni
giovanni.vallini@univr.it 045 802 7098; studio dottorandi: 045 802 7095Piano Didattico
Il piano didattico è l'elenco degli insegnamenti e delle altre attività formative che devono essere sostenute nel corso della propria carriera universitaria.
Selezionare il piano didattico in base all'anno accademico di iscrizione.
| Insegnamenti | Crediti | TAF | SSD |
|---|
| Insegnamenti | Crediti | TAF | SSD |
|---|
| Insegnamenti | Crediti | TAF | SSD |
|---|
1° Anno
| Insegnamenti | Crediti | TAF | SSD |
|---|
2° Anno
| Insegnamenti | Crediti | TAF | SSD |
|---|
3° Anno
| Insegnamenti | Crediti | TAF | SSD |
|---|
Legenda | Tipo Attività Formativa (TAF)
TAF (Tipologia Attività Formativa) Tutti gli insegnamenti e le attività sono classificate in diversi tipi di attività formativa, indicati da una lettera.
Bioinformatica e banche dati biologiche (2012/2013)
Codice insegnamento
4S02701
Crediti
6
Coordinatore
Settore Scientifico Disciplinare (SSD)
BIO/10 - BIOCHIMICA
Lingua di erogazione
Italiano
L'insegnamento è organizzato come segue:
Teoria
Crediti
3
Periodo
II semestre
Docenti
Daniele Dell'Orco
Laboratorio
Crediti
3
Periodo
II semestre
Docenti
Simone Zorzan
???OrarioLezioni???
Obiettivi formativi
Il corso si propone di fornire le basi teoriche e applicative di algoritmi e programmi utilizzati nella ricerca e nell’analisi primaria dei dati contenuti nelle principali banche dati biologiche di uso corrente, con particolare riferimento all’informazione in proteomica, genomica, biochimica, biologia molecolare e strutturale. Un’introduzione agli sviluppi più recenti della bioinformatica, quali l’analisi di dati da microarrays e la creazione di modelli dinamici e statici di reti biomolecolari avvicinerà lo studente all’emergente disciplina della systems biology.
Programma
Modulo di Teoria (Dr. Daniele Dell'Orco)
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- Ripasso delle principali proprietà strutturali di proteine e acidi nucleici in relazione all’evoluzione. Introduzione ai recenti sviluppi delle banche dati di interesse biologico e al loro utilizzo. Cenni ai programmi utilizzati in genomica funzionale, proteomica e genomica strutturale.
- Introduzione alle banche dati biomolecolari: Organizzazione e integrazione dell'informazione riguardante: a) sequenze di proteine e di acidi nucleici; b) strutture biomolecolari o di composti di interesse biologico; c) banche dati bibliografiche e specialistiche; recupero di informazione e ricerca per parole chiave combinate con operatori logici.
- Confronto di sequenze biologiche, algoritmi statici e dinamici di allineamento; matrici di punteggio e sostituzione (PAM, BLOSUM)
- Algoritmi di ricerca FASTA e BLAST; algoritmo di Smith-Waterman; algoritmo di Needleman-Wunsch; significatività statistica di un allineamento (z-score, valori di aspettativa e di probabilità)
- Allineamenti multipli di sequenze: l'algoritmo ClustalW; cenni ad altri algoritmi; ricerca in banche dati con allineamenti multipli; PSI-BLAST
- Cenno alle analisi filogenetiche e agli alberi filogenetici
- Introduzione ai microarrays, aspetti tecnici e sperimentali, cenni agli approcci per il trattamento e l’analisi dei dati.
- Introduzione alla systems biology: il sistema non come somma delle parti; modelli statici e modelli cinetici dinamici; frameworks matematici; introduzione ad SBTOOLBOX2 per Matlab; cenni alle reti di trasduzione del segnale
Modulo di Laboratorio (Dr. Simone Zorzan)
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- Introduzione all’ambiente Linux e ai fogli elettronici
- Introduzione ai database presso NCBI: l’interfaccia Entrez, Gene, Unigene, Protein. Uniprot e cenni di EBI srs.
- Allineamenti a coppie, matrici di punteggio e metodi ottimali: strumenti online e fogli di calcolo.
- BLAST, PSI-BLAST e BLAT: risorse online.
- Strumenti per gli allineamenti multipli, la banca dati Homologene e risorse online per il calcolo e la visualizzazione di allineamenti multipli.
- Strumenti per la filogenesi: Mobyle dell’Institut Pasteur e Phylogeny.fr
- Le banche dati per i microarrays: NCBI GEO e EBI ArrayExpress
- Systems Biology: costruzione di semplici modelli cinetici, e simulazione dell’evoluzione temporale con SBTOOLBOX2 per Matlab; applicazione: il ciclo di signaling delle proteine G
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Modalità d'esame
Scritto, con due valutazioni separate per teoria e laboratorio che poi saranno mediate. In caso si superasse solo una delle due parti, la singola valutazione rimarrà valide solo per la sessione in corso e per la successiva. Ritentare una prova (ritirare il testo dell'esame) significa rinunciare alla eventuale valutazione precedente. Parte del voto finale sarà attribuito in base alla valutazione delle presentazioni orali a gruppi di un database a scelta degli studenti.
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Tipologia di Attività formativa D e F
Insegnamenti non ancora inseriti
Prospettive
Avvisi degli insegnamenti e del corso di studio
Per la comunità studentesca
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Prova Finale
Per gli avvisi sulle sessioni di laurea, si rimanda al relativo servizio.
Per essere ammessi alla prova finale occorre avere conseguito tutti i crediti nelle attività formative previste dal piano degli studi. Alla prova finale sono riservati 3 CFU. La prova finale consiste nella discussione di un elaborato scritto, di non più di 25 cartelle, riguardante tematiche inerenti il percorso di studi, eventualmente affrontate nel corso del tirocinio sotto la guida di un Relatore. La relazione potrà essere redatta anche in lingua inglese ed una copia sarà trasferita alla Segreteria mediate apposita procedura telematica. Il docente referente e altri due docenti, costituiranno la Commissione di valutazione. I lavori della Commissione non sono regolati da convocazioni ufficiali e hanno luogo su accordo tra i quattro soggetti interessati.
La valutazione dell’elaborato sarà basata sui seguenti criteri: livello di approfondimento del lavoro svolto, impegno critico del laureando, accuratezza dello svolgimento. Alla fine della presentazione, i docenti stileranno una breve nota di valutazione con espressione di un voto sintetico. Questa nota sarà trasferita alla Segreteria competente, almeno 5 giorni prima della seduta di laurea, per la successiva formulazione del voto definitivo da parte della Commissione di laurea che procederà alla proclamazione. Il punteggio finale di Laurea è espresso in centodecimi con eventuale lode. Il punteggio minimo per il superamento dell’esame finale è di 66/110.
Il voto di ammissione è determinato rapportando la media degli esami di profitto ponderata sui crediti, a 110 e successivamente arrotondando il risultato all’intero più vicino. A parità di distanza, si arrotonda all’intero superiore.
Per la prova finale è previsto un incremento al massimo di 8/110 punti rispetto al voto di ammissione, di cui 4 punti riservati alla valutazione dell’esame di laurea e 4 punti riservati alla valutazione del curriculum dello studente. Nella valutazione del curriculum si tiene conto del tempo impiegato dallo studente per giungere alla laurea, del numero di lodi conseguite, e di eventuali esperienze all’estero.
Va attribuito un punto in più ai candidati che soddisfano i seguenti requisiti:
- laurea in corso
- media delle votazioni degli esami di almeno di 26/30.
L’attribuzione della lode, nel caso di un incremento che porti ad una votazione pari a 110/110, è a discrezione della commissione di esame e viene attribuita solo se il parere dei membri della commissione è unanime.
Elenco delle proposte di tesi e stage
| Proposte di tesi | Area di ricerca |
|---|---|
| Studio delle proprietà di luminescenza di lantanidi in matrici proteiche | Synthetic Chemistry and Materials: Materials synthesis, structure-properties relations, functional and advanced materials, molecular architecture, organic chemistry - Colloid chemistry |
| Nanomateriali ibridi organici-inorganici multifunzionali per applicazioni in Biotecnologie e Chimica Verde | Synthetic Chemistry and Materials: Materials synthesis, structure-properties relations, functional and advanced materials, molecular architecture, organic chemistry - New materials: oxides, alloys, composite, organic-inorganic hybrid, nanoparticles |
| Stampa 3D di nanocompositi polimerici luminescenti per applicazioni in Nanomedicina | Synthetic Chemistry and Materials: Materials synthesis, structure-properties relations, functional and advanced materials, molecular architecture, organic chemistry - New materials: oxides, alloys, composite, organic-inorganic hybrid, nanoparticles |
| Dinamiche della metilazione del DNA e loro contributo durante il processo di maturazione della bacca di vite. | Argomenti vari |
| Risposte trascrittomiche a sollecitazioni ambientali in vite | Argomenti vari |
| Studio delle basi genomico-funzionali del processo di embriogenesi somatica in vite | Argomenti vari |
Gestione carriere
Modalità di frequenza
Come riportato al punto 25 del Regolamento Didattico per l'A.A. 2021/2022, non è previsto un obbligo generalizzato di frequenza. I singoli docenti sono tuttavia liberi di richiedere un minimo di ore di frequenza per l’ammissibilità̀ all’esame di profitto dell’insegnamento di cui sono titolari. In tal caso il controllo della frequenza alle attività didattiche è stabilito secondo modalità preventivamente comunicate agli studenti.Per le modalità di erogazione della didattica, si rimanda alle informazioni in costante aggiornamento dell'Unità di Crisi.
Ulteriori servizi
I servizi e le attività di orientamento sono pensati per fornire alle future matricole gli strumenti e le informazioni che consentano loro di compiere una scelta consapevole del corso di studi universitario.