Codice insegnamento

4S009832

Docente

Rosalba Giugno

Coordinatore

Rosalba Giugno

Crediti

6

Lingua di erogazione

Inglese

Settore Scientifico Disciplinare (SSD)

INF/01 - INFORMATICA

Periodo

I semestre dal 1 ott 2024 al 31 gen 2025.

Corsi Singoli

Autorizzato

Orario Lezioni Moodle Seminari 0

Obiettivi di apprendimento

Il corso ha l’obiettivo di fornire le conoscenze di programmazione e algoritmiche necessari per l’analisi di dati multi-omici provenienti da dati da single cell e dati di trascrittomica spaziale. Conoscenza e capacità di comprensione L'insegnamento ha l'obiettivo di fornire allo studente la conoscenza e comprensione dei paradigmi e strumenti di programmazione avanzata e algoritmici per la gestione di dati da single cell e dati di trascrittomica spaziale. Conoscenze applicate e capacità di comprensione Lo studente sarà dunque in grado di a) applicare gli algoritmi e le strutture dati avanzate per l’analisi di dati da single cell e dati di trascrittomica spaziale; b) applicare l'analisi delle prestazioni del codice e individuazione di criticità e loro ottimizzazione. Autonomia di giudizio Capacità di proporre in modo autonomo soluzioni efficaci ed efficienti per il dominio applicativo biomedico e bioinformatico; capacità di individuare le criticità per il trattamento di problemi complessi di analisi di dati da single cell e trascrittomica spaziale, e dati ottenuti integrando omiche diverse. Abilità comunicative Lo studente sarà, inoltre, in grado di interagire con interlocutori vari in un ambito multidisciplinare biomedico e bioinformatico, relazionarsi con i colleghi nello svolgimento di lavori in gruppo, e relazionarsi con gli interlocutori nell'ambiente lavorativo o di ricerca. Capacità di apprendere Capacità di comprendere la letteratura scientifica nel processo di interpretazione dei risultati o soluzione proposta, e di svolgere lavori di approfondimento individuale e di gruppo volti ad affrontare problemi dal mondo della ricerca e aziendale.

Prerequisiti e nozioni di base

Nozioni concettuali e pratica di linguaggi di programmazione

Programma

Strutture dati e algoritmi per analizzare:
-dati di singola cellula,
-dati di trascrittomica spaziale
-omiche multimodali
Applicazione su studi reali presentati dagli esperti Bio/Med del settore.
Approfondimento tramite seminari da esperti internazionali sugli aspetti computazionali e sulle tecnologie di produzione del dato.

Modalità didattiche

Gli studenti seguiranno lezioni teoriche ed esercitazioni il cui contenuto sarà fornito tramite notebook o R Markdown. Gli studenti installeranno e utilizzeranno i software relativi agli argomenti scelti e analizzeranno casi reali.

Modalità di verifica dell'apprendimento

Sviluppo di un progetto in classe (o da remoto da valutare con il docente).

Criteri di valutazione

Spiegazione, attraverso presentazione e demo, critica e dettagliata, delle metodologie utilizzate per lo sviluppo del progetto e dei risultati biomedicali ottenuti. La presentazione può avvenire in fronte ad esperti delle applicazioni trattate.

Criteri di composizione del voto finale

Il voto è composto dalla valutazione di tre fattori: autonomia, competenza, senso critico che lo/a studente/ssa ha dimostrato durante lo sviluppo del progetto e durante la presentazione.

Lingua dell'esame

Inglese