Studiare

In questa sezione è possibile reperire le informazioni riguardanti l'organizzazione pratica del corso, lo svolgimento delle attività didattiche, le opportunità formative e i contatti utili durante tutto il percorso di studi, fino al conseguimento del titolo finale.

Piano Didattico

A.A. 2024/2025 A.A. 2023/2024 A.A. 2022/2023 A.A. 2021/2022 A.A. 2020/2021 A.A. 2019/2020 A.A. 2018/2019 A.A. 2017/2018 A.A. 2016/2017 A.A. 2015/2016

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Laurea magistrale in Molecular and Medical Biotechnology - Immatricolazione dal 2025/2026

Il piano didattico è l'elenco degli insegnamenti e delle altre attività formative che devono essere sostenute nel corso della propria carriera universitaria.
Selezionare il piano didattico in base all'anno accademico di iscrizione.

Attivato nell'A.A. 2023/2024
InsegnamentiCreditiTAFSSD
2
F
-
12
D
-
40
E
-
Insegnamenti Crediti TAF SSD
Tra gli anni: 1°- 2°
2 courses among the following ("BIOTECHNOLOGY IN NEUROSCIENCE" 1ST YEAR; "CLINICAL PROTEOMICS" 1ST and2ND YEAR; the other courses 2nd year only)
6
C
BIO/17
6
C
CHIM/01
6
C
BIO/15
6
C
FIS/01
6
C
MED/04
6
C
BIO/15

Legenda | Tipo Attività Formativa (TAF)

TAF (Tipologia Attività Formativa) Tutti gli insegnamenti e le attività sono classificate in diversi tipi di attività formativa, indicati da una lettera.

A Attività di base
B Attività caratterizzanti
C Attività formative affini o integrative
D Attività a scelta dello studente
E Prova finale
F Altre attività formative
S Stage e tirocini presso imprese, enti pubblici o privati, ordini professionali

Computational biology  (2022/2023)

Codice insegnamento

4S003658

Docente

Alejandro Giorgetti

Coordinatore

Alejandro Giorgetti

Crediti

6

Lingua di erogazione

Inglese en

Settore Scientifico Disciplinare (SSD)

BIO/10 - BIOCHIMICA

Periodo

Secondo semestre dal 6 mar 2023 al 16 giu 2023.

Orario Lezioni MoodleMoodle Seminari 0

Obiettivi di apprendimento

Questo corso fornisce un'introduzione alle moderne tecniche della biologia molecolare computazionale e al disegno razionale di proteine attraverso il PC. Gli argomenti trattati riguardano sopratutto le tecniche di simulazione di dinamica molecolare e concetti avanzati di bioinformatica strutturale. Al termine dell’insegnamento lo studente dovrà dimostrare di essere in grado di - capire in profondità un articolo scientifico in cui tecniche computazionali vengono utilizzati - Introdurre (in silico) mutanti per modificare la struttura/funzione di una proteina - Preparare il sistema e girare simulazioni di dinamica molecolare utilizzando programmi allo stato dell'arte

Prerequisiti e nozioni di base

Non ci sono propedeuticità

Programma

Parte A – Bioinformatica

− Bioinformatica strutturale avanzata.
- Basi termodinamiche della stabilità di strutture biomolecolari.
− Molecular basis of human perception


Part B – Modellizzazione Molecolare

− Nozioni basiche
− Campi di forza
- Simulazioni di dinamica molecolare: Gromacs
− Conformational analysis


Part C – Interazione delle proteine con i partner cellulari.

− Complessi proteina-pr, proteina-piccole molecole: Algoritmi e programmi principali.
− Progetto: Drug and/or protein design

Bibliografia

Vai alla bibliografia
Visualizza la bibliografia con Leganto, strumento che il Sistema Bibliotecario mette a disposizione per recuperare i testi in programma d'esame in modo semplice e innovativo.

Modalità didattiche

Durante il corso vengono utilizzate diverse tecniche di insegnamento:
- Lezioni teoriche classiche
- esercitazioni pratiche al PC (utilizzo di programmi all'avanguardia per l'esecuzione di simulazioni di dinamica molecolare, docking e progettazione di farmaci)
- Analisi della letteratura Tradotto con www.DeepL.com/translator (versione gratuita)

Modalità di verifica dell'apprendimento

Scritto.
L'esame è diviso in una parte di presentazione di un articolo in cui vengono utilizzate tecniche allo stato dell'arte nel campo della biologia computazionale.
La seconda parte riguarda un esame scritto con domande aperte sugli argomenti trattati durante il corso.

Le/gli studentesse/studenti con disabilità o disturbi specifici di apprendimento (DSA), che intendano richiedere l'adattamento della prova d'esame, devono seguire le indicazioni riportate QUI

Criteri di valutazione

Lo studente deve:
-essere in grado di padroneggiare il linguaggio specifico della moderna biologia computazionale.
-essere in grado di capire in modo critico un articolo scientifico nell'ambito della biologia computazionale
-Conoscere le basi teoriche della dinamica molecolare e del docking virtuale

Criteri di composizione del voto finale

Il voto finale si compone di:
- Voto della presentazioni a gruppi di articoli scientifici dei alto impatto
- Voto dell'esame scritto in sede di appello di esame

Lingua dell'esame

Inglese